MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid1

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008341	CCG	2	6	24	29	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008341	GGCG	2	8	50	57	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008341	ATT	2	6	92	97	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008341	GGC	2	6	110	115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008341	GCA	2	6	125	130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008341	GGC	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008341	ATT	2	6	3751	3756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008341	TC	3	6	3759	3764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008341	TAA	2	6	5560	5565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008341	TAG	2	6	5566	5571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008341	TAC	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008341	TAT	3	9	5584	5592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008341	AGA	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008341	TGTT	2	8	5630	5637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008341	GGAT	2	8	5742	5749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008341	GC	3	6	5773	5778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008341	ATT	2	6	5820	5825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008341	TAA	2	6	5830	5835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008341	TG	3	6	5842	5847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008341	AAAG	2	8	6579	6586	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008341	AAAG	2	8	6588	6595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008341	AG	3	6	6594	6599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008341	TAA	2	6	6621	6626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008341	TATT	2	8	6648	6655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008341	ATT	2	6	6728	6733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008341	TA	3	6	6747	6752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008341	GC	3	6	6773	6778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008341	TCTA	2	8	6795	6802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008341	ACG	2	6	6833	6838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008341	AAG	2	6	6873	6878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008341	C	7	7	6887	6893	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_008341	GTGTTG	2	12	8228	8239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008341	GCT	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008341	ATT	2	6	8295	8300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008341	TGA	2	6	9427	9432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008341	GTT	2	6	9456	9461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008341	AAT	2	6	20407	20412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008341	ATC	2	6	21819	21824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008341	CTG	2	6	23403	23408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008341	TC	3	6	23471	23476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008341	AGT	2	6	23477	23482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008341	GCT	2	6	23499	23504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008341	TCG	2	6	23557	23562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008341	ATA	2	6	23564	23569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008341	GCA	2	6	23589	23594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008341	AT	3	6	23614	23619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008341	T	6	6	23619	23624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008341	AAT	2	6	28632	28637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008341	TAT	2	6	28682	28687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008341	T	7	7	29008	29014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008341	A	7	7	29015	29021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008341	TAC	2	6	29022	29027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008341	AAAT	2	8	30028	30035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008341	AG	3	6	30098	30103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008341	ATTAA	2	10	30436	30445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008341	A	7	7	30444	30450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008341	T	6	6	30457	30462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008341	GCA	2	6	30463	30468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008341	A	7	7	30508	30514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008341	A	8	8	30520	30527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008341	TTA	2	6	30587	30592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008341	AATT	2	8	31409	31416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008341	TTA	2	6	31421	31426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008341	TTA	2	6	31431	31436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008341	ACA	2	6	32088	32093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008341	AG	3	6	32144	32149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008341	TGA	2	6	36711	36716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008341	ATTA	2	8	36809	36816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008341	GGA	2	6	36825	36830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008341	GTC	2	6	36838	36843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008341	TCAA	2	8	40457	40464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008341	CTC	2	6	40750	40755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008341	GGCT	2	8	40791	40798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008341	CCT	2	6	41413	41418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_008341	TTTCG	2	10	43119	43128	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008341	TTTGG	2	10	44239	44248	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008341	AGCTTA	2	12	44251	44262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008341	TTA	2	6	45202	45207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008341	AAAT	2	8	45283	45290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008341	GCT	2	6	45349	45354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008341	AGTA	2	8	45376	45383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008341	AAG	2	6	47885	47890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008341	TTGT	2	8	47894	47901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008341	TTGTC	2	10	49154	49163	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008341	GTC	2	6	49171	49176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008341	GCG	2	6	49187	49192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008341	T	7	7	49219	49225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008341	GTT	3	9	49244	49252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008341	AT	3	6	49354	49359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008341	TGCGT	2	10	49362	49371	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008341	ATTT	2	8	49398	49405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008341	T	6	6	49458	49463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008341	CCT	2	6	49501	49506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_008341	ATT	2	6	49557	49562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008341	ATA	2	6	49637	49642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008341	ATA	2	6	49647	49652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008341	GAG	2	6	49786	49791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008341	T	7	7	58775	58781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008341	ATG	2	6	58921	58926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008341	ATA	2	6	58929	58934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008341	GTTT	2	8	59890	59897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008341	T	6	6	59895	59900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008341	GTT	2	6	59912	59917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008341	CTT	2	6	59931	59936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008341	CAA	2	6	60244	60249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008341	GCC	2	6	60353	60358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_008341	CCG	2	6	60535	60540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008341	A	6	6	60567	60572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008341	TTG	2	6	60714	60719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008341	GCAG	2	8	60726	60733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008341	GAG	2	6	60751	60756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008341	AAGT	2	8	62229	62236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008341	CAAAA	2	10	62242	62251	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008341	AAGT	2	8	62263	62270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008341	CAAAA	2	10	62276	62285	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008341	A	6	6	62282	62287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008341	ATA	2	6	62377	62382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008341	GAA	2	6	62407	62412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008341	TGC	2	6	62439	62444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008341	CTCA	2	8	62482	62489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008341	T	7	7	62670	62676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008341	T	6	6	62722	62727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008341	GAC	2	6	62739	62744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008341	CT	3	6	62807	62812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008341	TCA	2	6	62883	62888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008341	ATG	2	6	62903	62908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008341	AAG	2	6	62910	62915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008341	T	6	6	62973	62978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008341	CG	3	6	63027	63032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008341	GTT	2	6	63052	63057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008341	T	6	6	63079	63084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008341	GGA	2	6	64383	64388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008341	CAT	2	6	64452	64457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008341	CAG	2	6	64506	64511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008341	GCC	2	6	64605	64610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_008341	ATCGGA	2	12	64788	64799	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_008341	TTGC	2	8	64831	64838	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008341	ATTT	2	8	64859	64866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008341	CTG	2	6	64990	64995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008341	ACC	2	6	65059	65064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.